Al snel had Hans een compagnon gevonden in de persoon van Ton van Beek. Circa 2 jaar na de oprichting kwam Martien Meijer (een oud-student van Hans) het bureau versterken. Hij is sinds 1995 lid van de directie, sinds 2014 met Wouter Lengkeek en Eelco Waardenburg. Begin jaren ’90 wordt zusterorganisatie Delta Milieu opgericht; een uitzendorganisatie voor ecologen. Later zijn BWZ ingenieurs (dat als zelfstandige onderneming is doorgegaan) en BESE-products opgericht.

Zeeland is een belangrijk onderzoeksgebied voor Waardenburg Ecology gebleven. Al in de jaren ’80 is ‘het Zijpe’ in Bruinisse aangekocht; oorspronkelijk een wachtlokaal en café voor de plaatselijke pont, maar al snel omgebouwd tot een uitvalsbasis voor veldwerk in de Zeeuwse delta. Sinds 1995 is Waardenburg Ecology gehuisvest in het huidige statige herenhuis aan de sfeervolle Varkensmarkt in Culemborg. In 2020 is een werklocatie geopend in Nijmegen. In 2023 zijn we gegroeid naar ruim 150 medewerkers.

Koeman en Bijkerk bv is in 1994 ontstaan door het samengaan van Tripos en Aquatic Ecosystems. Koeman en Bijkerk was het eerste commerciële ecologische bureau met een kwaliteitsmanagementsysteem gebaseerd op ISO 9001 en later NEN EN 17025:2005. De directie werd gevoerd door Ronald Bijkerk en Karin Fockens. In 2017 werd het onderdeel van Waardenburg Ecology onder de naam Locatie Haren (Gn) en is gegroeid van 13 medewerkers (2017), naar 21 (2022).